V řadě případů není potřeba bělit všechny zuby kompletně ( případně to ani není přáním zákazníka) ale je nutné vybělit jen jeden nebo několik zubů, které jsou výrazně tmavší než zuby okolní. Nejčastější příčinou tohoto stavu jsou tzv. mrtvé zuby, tedy takové zuby, v nichž odumřel zubní nerv (většinou v důsledku hlubokého kazu), a ony po zaplnění kořenových kanálků začaly tmavnout. Tyto individuální barevné diskolorace se bělí přímo zevnitř zubu, z původního kořenového kanálku, který se musí důkladně vyčistit a pak se do něj aplikuje účinný bělící gel, který je v kanálku bezpečně uzavřen, a několik dní zde působí. Tuto techniku lze i několikrát opakovat, nebo se může kombinovat s cíleným vnějším bělením konkrétního zubu.
Tato forma bělení se používá i v případech, kdy se na zub zhotovuje estetická celokeramická korunka i faseta, aby zub získal přirozenou barvu a procházelo jím světlo stejně jako u ostatních zdravých zubů. Vnitřní bělení je vhodné provést i u kovokeramických prací, protože po odhalení krčku při jeho tmavém zbarvení bývá nutné korunky předělat, zatímco i přirozeného zbarvení může práce fungovat dál, a jako celek se zubem působí stále přirozeně.
Účinky vnitřního bělení jsou navíc někdy natolik účinné, že i v případě hodně tmavých zubů, kde byla navrhována celokeramické práce, dojde k takovému stupni vybělení, že žádná další estetická korekce již není zapotřebí.
